У Сектору за управљање животном средином обављају се послови који се односе на: утврђивање, координирање и развој циљева политике заштите животне средине; координацију израде и реализације стратегија, програма, планова и пројеката у области управљања животном средином; праћење препорука, директива и других прописа европског законодавства у области управљања животном средином; имплементацију међународних конвенција, споразума, закона и других прописа; утврђивање услова заштите животне средине за изградњу објеката и извођење радова кроз процену утицаја на животну средину; давање мишљења на одлуке о изради стратешке процене утицаја, давање сагласности на извештаје о стратешкој процени утицаја и давање мишљења за просторне планове од републичког значаја; примена Конвенције о процени утицаја на животну средину у прекограничном контексту (ЕСПОО конвенција) и Протокола о стратешкој процени утицаја (СЕА протокол) при спровођењу прекограничних консултација за пројекте у процедури примене закона о процени утицаја на животну средину и стратешкој процени утицаја; утврђивање услова заштите животне средине од хемијског удеса кроз преглед и давање сагласности на Извештај о безбедности и План заштите од удеса за севесо постројења; спровођење Конвенције о прекограничним ефектима индустријских удеса; давање мишљења и утврђивање мера и услова заштите животне средине од великог хемијског удеса за потребе израде просторних и урбанистичких планова на свим нивоима, по захтеву носиоца израде плана; сарадња са суседним државама у поступку обавештавања, односно размени података о севесо постројењима у прекограничном контексту, праћење развоја најбоље доступних техника за потребе интегрисаног спречавања и контроле загађења животне средине, издавање интегрисаних дозвола сходно Закону о интегрисаном спречавању и контроли загађивања животне средине, координација сарадње са јединицама локалне самоуправе у области заштите животне средине, унапређење родне равноправности и јачање улоге осетљивих друштвених група у систему заштите животне средине, учешће у спровођењу Конвенције о доступности информација, учешћу јавности у доношењу одлука и праву на правну заштиту у питањима животне средине (Архуска конвенција); учешће у процесима који су у вези са стручним усавршавањем државних службеника у Сектору, сарадња са научним и стручним институцијама из области делокруга рада Сектора као и др. институцијама и организацијама; и друге послове из ове области.
У Сектору за управљање животном средином образују се уже унутрашње јединице:
- Одсек за правне послове у области управљања животном средином
- Одељење за процену утицаја на животну средину
- Одељење за интегрисане дозволе
- Одељење за заштиту од великог хемијског удеса
- Одсек за подршку јединицама локалне самоуправе и унапређење родне равноправности у систему заштите животне средине