Сектор за управљање животном срединoм обавља послове који се односе на:
- утврђивање, координирање и развој циљева политике заштите животне средине везаних за увођење стандарда и чистије производње у функцији одрживог развоја;
- реализацију Стратегије увођења чистије производње у Републици Србији;
- организовање, спровођење и контрола система еколошког означавања – Еколошки знак Републике Србије;
- праћење европских стандарда и методологија ради регистровања сертификованих система управљања заштитом животне средине ИСО 14001 у организацијама;
- припремање потребних услова за увођење издавања EMAS сертификата у Републици Србији и вођење регистра правних и физичких лица укључених у систем EMAS;
- утврђивање услова заштите животне средине за изградњу објеката и извођење радова кроз процену утицаја на животну средину;
- утврђивање услова заштите животне средине од хемијског удеса кроз преглед и давање сагласности на Извештај о безбедности и План заштите од удеса за севесо постројења;
- сарадња са суседним државама у поступку обавештавања, односно размени података о севесо постројењима у прекограничном контексту;
- давање мишљења на одлуке о изради стратешке процене утицаја, доношење решења на извештаје о стратешкој процени утицаја и давање мишљења за просторне планове од републичког значаја;
- праћење развоја најбоље доступних техника за потребе интегрисаног спречавања и контроле загађења животне средине;
- издавање интегрисаних дозвола сходно Закону о интегрисаном спречавању и контроли загађења животне средине и контролу утицаја на животну средину постројења за које је издата интегрисана дозвола;
- заштиту ваздуха и озонског омотача;
- унапређење квалитета ваздуха;
- успостављање и одржавање система за управљање квалитетом ваздуха;
- утврђивање стања квалитета ваздуха;
- управљање хемикалијама и биоцидним производима;
- заштита од буке, вибрација и нејонизујућих зрачења;
- обавља и друге послове из ове области.
У Сектору за управљање животном средином образују се уже унутрашње јединице:
- Група за нормативно-правне послове у области управљања животном средином
- Одељење за процену утицаја пројеката и активности на животну средину,
- Одељење за интегрисане дозволе
- Група за стандарде и чистију производњу
- Одељење за заштиту ваздуха и озонског омотача
- Одсек за заштиту од великог хемијског удеса
- Одсек за заштиту од буке, вибрација и нејонизујућих зрачења
- Одељење за хемикалије
- Групa за заштиту животне средине од дејства штетних организама